Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDR1Q08345 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms