Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2A2P52657 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms