Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE6BP35913 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE6BP35913 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms