Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF2P35240 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF2P35240 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NF2P35240 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NF2P35240 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NF2P35240 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NF2P35240 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF2P35240 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NF2P35240 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NF2P35240 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NF2P35240 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms