Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNNB1P35222 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNB1P35222 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms