Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXA10P31260 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms