Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCN1P20061 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TCN1P20061 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCN1P20061 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms