Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL5P13501 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL5P13501 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL5P13501 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCL5P13501 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCL5P13501 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCL5P13501 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCL5P13501 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL5P13501 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL5P13501 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL5P13501 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCL5P13501 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCL5P13501 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms