Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
ABCC9O60706 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ABCC9O60706 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms