Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPRY3O43610 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms