Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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TDP1Q9NUW8 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TDP1Q9NUW8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TDP1Q9NUW8 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TDP1Q9NUW8 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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TDP1Q9NUW8 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TDP1Q9NUW8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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