Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CDKN3Q16667 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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