Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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ECM1Q16610 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ECM1Q16610 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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