Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCBQ16585 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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