Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VAMP3Q15836 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VAMP3Q15836 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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