Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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