Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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