Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEC23BQ15437 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SEC23BQ15437 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEC23BQ15437 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEC23BQ15437 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEC23BQ15437 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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