Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRRQ15256 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRRQ15256 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRRQ15256 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRRQ15256 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRRQ15256 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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PTPRRQ15256 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRRQ15256 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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