Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SGCGQ13326 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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