Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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