Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PTPRBP23467 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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