Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TRHP20396 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
TRHP20396 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRHP20396 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms