Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CEP290O15078 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CEP290O15078 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CEP290O15078 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CEP290O15078 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CEP290O15078 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CEP290O15078 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CEP290O15078 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CEP290O15078 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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