Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
VAMP3Q15836 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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