Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HMGN3Q15651 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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