Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms