Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SS18Q15532 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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SS18Q15532 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SS18Q15532 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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