Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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