Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RYR3Q15413 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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