Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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PDCD1Q15116 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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PDCD1Q15116 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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PDCD1Q15116 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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PDCD1Q15116 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PDCD1Q15116 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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