Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NCOA4Q13772 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms