Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
LAMB3Q13751 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMB3Q13751 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMB3Q13751 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMB3Q13751 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
LAMB3Q13751 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms