Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ALCAMQ13740 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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