Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
ITGB3BPQ13352 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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ITGB3BPQ13352 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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