Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHAF1AQ13111 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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