Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms