Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNTN1Q12860 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNTN1Q12860 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNTN1Q12860 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNTN1Q12860 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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CNTN1Q12860 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CNTN1Q12860 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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