Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA5P20719 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA5P20719 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms