Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COPS7AQ9UBW8 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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