Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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DTX3Q8N9I9 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DTX3Q8N9I9 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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