Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms