Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
KRTAP21-1Q3LI58 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms