Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NRF1Q16656 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms