Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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