Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms