Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SS18Q15532 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SS18Q15532 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms