Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms