Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CNGB1Q14028 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CNGB1Q14028 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms