| RUNX2 | Q13950 | AC016598.2-201 | ENST00000514942 | 525 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-150P-201 | ENST00000516237 | 95 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGLVIV-53-201 | ENST00000520107 | 367 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSBPL9P2-201 | ENST00000526582 | 1228 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087276.1-201 | ENST00000529659 | 480 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLRF2-201 | ENST00000535540 | 731 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092112.1-201 | ENST00000538329 | 640 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025265.1-201 | ENST00000551299 | 497 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC125603.1-201 | ENST00000552718 | 366 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01491-202 | ENST00000558792 | 439 nt | TSL 3 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD36BP2-206 | ENST00000575193 | 1245 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157938.2-201 | ENST00000587264 | 894 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00347-205 | ENST00000597518 | 868 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-238 | ENST00000604253 | 709 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 5S_rRNA.16-201 | ENST00000612928 | 119 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092683.2-203 | ENST00000618807 | 788 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009318.4-201 | ENST00000620496 | 486 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01002-227 | ENST00000633363 | 541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC140479.6-201 | ENST00000633535 | 357 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF345-216 | ENST00000640438 | 963 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LPAR4-201 | ENST00000435339 | 2611 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GDI2P1-201 | ENST00000429312 | 1336 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01630-206 | ENST00000635103 | 4292 nt | TSL 5 BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF733P-201 | ENST00000331425 | 1506 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CR381670.1-201 | ENST00000624291 | 1693 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HERC4-204 | ENST00000395198 | 4445 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD80-201 | ENST00000264246 | 2725 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01847-201 | ENST00000522627 | 5607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNJ13-201 | ENST00000233826 | 2950 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAMSN1-201 | ENST00000285670 | 2185 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LCA5L-201 | ENST00000288350 | 2416 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ORMDL1-201 | ENST00000325795 | 2692 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEC31A-203 | ENST00000348405 | 4012 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CPNE8-202 | ENST00000360449 | 1757 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PJA2-202 | ENST00000361557 | 4645 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP88-201 | ENST00000365560 | 109 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL3-201 | ENST00000370839 | 1575 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007066.1-201 | ENST00000392902 | 381 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LAP3P1-201 | ENST00000403648 | 294 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VN1R8P-201 | ENST00000407739 | 893 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AMMECR1LP1-201 | ENST00000415152 | 841 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO1P23-201 | ENST00000415223 | 1526 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093159.1-201 | ENST00000416845 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NPM1P11-201 | ENST00000417106 | 855 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBTFL3-201 | ENST00000418934 | 1024 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158834.1-201 | ENST00000419441 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL645937.4-201 | ENST00000419702 | 389 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138024.1-201 | ENST00000420867 | 699 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157831.1-201 | ENST00000426134 | 473 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035410.1-201 | ENST00000427409 | 427 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DIAPH3-AS2-201 | ENST00000428656 | 367 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016712.1-201 | ENST00000431088 | 378 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL132765.1-201 | ENST00000434165 | 553 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS3AP54-201 | ENST00000435535 | 734 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4P6-201 | ENST00000438297 | 472 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00280-201 | ENST00000439525 | 448 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000844.1-201 | ENST00000446631 | 577 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP34-201 | ENST00000453983 | 808 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005008.1-201 | ENST00000456151 | 612 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL30P9-201 | ENST00000465586 | 330 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBTFL6-201 | ENST00000477929 | 1024 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109486.1-201 | ENST00000486833 | 374 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SATB1-216 | ENST00000491519 | 1000 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DCAF13P1-201 | ENST00000495256 | 1330 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092045.1-201 | ENST00000495716 | 1231 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GPX8-203 | ENST00000503787 | 1411 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079349.1-201 | ENST00000509096 | 589 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093840.1-201 | ENST00000511599 | 336 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021146.3-201 | ENST00000511911 | 260 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | VCAN-AS1-201 | ENST00000512090 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026412.2-201 | ENST00000512270 | 1075 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HHIP-AS1-203 | ENST00000512359 | 646 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005798.1-201 | ENST00000513715 | 387 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010280.3-201 | ENST00000515504 | 587 nt | TSL 4 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015468.4-201 | ENST00000523496 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPA8P13-201 | ENST00000523715 | 472 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100770.1-201 | ENST00000532310 | 322 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01491-201 | ENST00000558434 | 505 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356489.2-201 | ENST00000566968 | 3528 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012435.1-202 | ENST00000568772 | 240 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4284-201 | ENST00000578924 | 81 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01893-201 | ENST00000581750 | 479 nt | TSL 3 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC040904.1-201 | ENST00000590850 | 223 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P11-201 | ENST00000603878 | 563 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158163.1-201 | ENST00000603915 | 1649 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010680.3-201 | ENST00000604215 | 520 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091979.2-201 | ENST00000607514 | 214 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114781.5-201 | ENST00000615297 | 108 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025588.4-201 | ENST00000615802 | 908 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRG2-210 | ENST00000638772 | 7669 nt | TSL 5 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRB2-203 | ENST00000393959 | 7191 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OTOGL-202 | ENST00000458043 | 8083 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCN1A-220 | ENST00000641603 | 12506 nt | BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | POSTN-201 | ENST00000379742 | 3071 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STK31-205 | ENST00000433467 | 3085 nt | TSL 2 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR2H1-202 | ENST00000377133 | 3021 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.08 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNTRL-201 | ENST00000238341 | 7431 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMC6-203 | ENST00000402989 | 3729 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P3-201 | ENST00000438536 | 1800 nt | BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TFPI-203 | ENST00000392365 | 3649 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.07 | □□□□□ -1.76 | | |